В течение трёх военных лет, с 1941 по 1944 годы, здесь было погребено по разным данным от 470 тыс. до 520 тыс. человек, пик захоронений пришёлся на первую блокадную зиму. Проводились погребения траншейным способом, без венков, гробов и речей.

С 1961 года Пискарёвское кладбище становится главным памятником ленинградским героям, одновременно с этим здесь создаётся музейная экспозиция, посвящённая трагическим страницам истории блокадного Ленинграда. Именно здесь можно увидеть знаменитый дневник ленинградской школьницы Тани Савичевой, сейчас экспозиция располагается на первом этаже правого павильона.

Мемориал «Родина-Мать» на Пискаревском кладбище
В мае 1960 года, к пятнадцатой годовщине победы в Великой Отечественной войне на месте братских могил защитников Ленинграда и жителей города установили мемориальный комплекс, который каждый год становится центром проведения памятных церемоний возложения венков. На верхней террасе мемориала горит вечный огонь, зажжённый от огня на Марсовом поле. От него простирается Центральная аллея с ответвляющимися братскими могилами с надгробными плитами. На каждой плите выгравирован год погребения и дубовый лист, олицетворяющий героизм и мужество, на воинских могилах высечены пятиконечные звезды. Бронзовая скульптура «Мать-Родина» и мемориальная стена с эпитафией Ольги Берггольц завершают композицию комплекса.

«Здесь лежат ленинградцы.
Здесь горожане — мужчины, женщины, дети.
Рядом с ними солдаты-красноармейцы.
Всею жизнью своею
Они защищали тебя, Ленинград,
Колыбель Революции.
Их имен благородных мы здесь перечислить не сможем.
Так их много под вечной охраной гранита.
Но знай, внимающий этим камням,
Никто не забыт и ничто не забыто.

В город ломились враги, в броню и железо одеты,
Но с армией вместе встали
Рабочие, школьники, учителя, ополченцы.
И все, как один, сказали они:
Скорее смерть испугается нас, чем мы смерти.
Не забыта голодная, лютая, темная
Зима сорок первого—сорок второго,
Ни свирепость обстрелов,
Ни ужас бомбежек в сорок третьем.
Вся земля городская пробита.
Ни одной вашей жизни, товарищи, не позабыто.
Под непрерывным огнем с неба, с земли и с воды
Подвиг свой ежедневный
Вы совершали достойно и просто,
И вместе с Отчизной своей
Вы все одержали победу.
Так пусть же пред жизнью бессмертною вашей
На этом печально-торжественном поле
Вечно склоняет знамена народ благодарный,
Родина-Мать и Город-герой Ленинград».
(О. Ф. Берггольц)

Надпись на мраморной доске перед входом на кладбище гласит: «С 8 сентября 1941 года по 22 января 1944 года на город было сброшено 107 158 авиабомб, выпущено 148 478 снарядов, убито 16 744 человек, ранено 33 782, умерло от голода 641 803 человек».